所徽的設計首先突出了研究所的科學目標：“從地球整體環(huán)境系統(tǒng)（大氣、大陸、海洋等）和圈層（巖石圈、水圈、生物圈和大氣圈）各因子相互作用和耦合過程的角度，在全球和區(qū)域層次上開展大陸環(huán)境系統(tǒng)不同尺度時空變遷規(guī)律和機制的研究”，因此所徽由三個圓環(huán)組成，象征著地球不同圈層和不同子系統(tǒng)的相互作用和耦合過程，組成的圓圈代表地球，其中外圈為“中國科學院地球環(huán)境研究所，Institute of Earth Environment, CAS”，即研究所中英文全稱。圈內(nèi)由一條逐步上升的曲線連接，表示研究所不斷發(fā)展，研究水平的不斷攀升，曲線的4個上升階梯象征著我國現(xiàn)代3大地貌階梯和周邊海域，意指：研究所以東亞大陸環(huán)境為主要研究對象；曲線同時也是各種記錄（地質、生物和歷史文獻）的科學表述形式，表明研究所強調記錄，注重實驗的科學學風；曲線的波浪起伏，象征著攀登科學道路的艱辛；同時曲線的波浪上升暗示著只有意志堅定、不畏困難的人才能達到科學的頂峰，并且象征著研究所將不斷地從一個輝煌走向另一個輝煌。
研究所新設計的所徽，濃縮著研究所原有的十數(shù)年的研究積淀和未來研究的構想，成為全所職工都普遍認同的新標志，這將進一步激發(fā)每一位科研人員愛所的感情，增加其作為研究所一分子的自豪感，激勵他們在科學道路上取得更優(yōu)異的成績。